Начиная с 1997 года Группа компаний «Агентство Рефперевозки» осуществляет перевозки скоропортящихся грузов по железным дорогам России. Приоритетным маршрутом для группы компаний является Москва-Владивосток-Москва – стратегические направления перевозок грузов для хозяйства Российской Федерации.
Осознавая перспективность использования рефрижераторных контейнеров как оптимальных транспортных средств для перевозки скоропортящихся грузов, парк Группы компаний в период с 2005 по 2012 практически полностью поменялся с вагонов рефрижераторных секций на рефрижераторные контейнеры и электрифицированные фитинговые платформы. Сегодня Группа компаний «Агентство Рефперевозки оперирует парком около 1000 рефрижераторных контейнеров, соответствующим парком электрифицированных фитинговых платформ, комплектом навесных дизельгенераторов «Дженсетов» для авто перевозок.